区别大小黄花鱼首先要看头部上的鱼嘴，大黄花鱼下唇长于上唇，口闭的较圆。小黄花鱼上下唇相等，口闭时较尖；其次，大黄花鱼的鳞较小，在背鳍起点与侧线间有8～9个鳞片，而小黄花鱼的鳞片较大，从背鳍起与侧线间有5～6个鳞片；大黄花鱼尾柄细长，鳞片较小，椎骨25～27枚；小黄花鱼尾柄较短，鳞片较大，椎骨28～30枚。