雄圆鳗体型比雌圆鳗大，下颚也比雌圆鳗的长。到了繁殖期，雌雄圆鳗分别把它们的洞移动到一起进行交配。雄圆鳗这个时候会保护自己的雌圆鳗不被其他雄圆鳗侵扰，对于来犯者，雄圆鳗会用身体击打对手的身体，或者咬对手的脑袋。

交配过后，圆鳗们把受精卵释放到周围的水中，让受精卵随着海流漂走。受精卵浮到海水的表层孵化成小圆鳗。小圆鳗会在海水中漂游一段时间，当它们长到足够大时，就会游向海底做洞，然后就一直生活在洞里了。