海鬣蜥只生活在厄瓜多尔西部热带水域的加拉帕格斯群岛。

在这里的海鬣蜥又分了7种，分布在群岛东南部西班牙岛上的海鬣蜥与其他6种有着明显的差别，雄性身上有红、黄、黑3色相间的斑，腿、足和冠部呈墨绿色，而其他岛屿上的海鬣蜥身上没有花斑，通身呈绿色或黄色。